【摘要】为了解塔里木河下游流域内在生态输水后的水生生物资源及生态环境特征，于2019年-2020年对塔里木河中下游干流、车尔臣河、台特玛湖3个区域的大型底栖动物群落结构进行了调查研究，并探讨其环境影响因素。调查结果显示，塔里木河下游流域中大型底栖动物共97个分类单元，隶属于3门4纲10目27科。水生昆虫为主要类群（82种），其中双翅目（47种）物种数最多，其次为鞘翅目（14种）、蜻蜓目（13种）。摇蚊科物种在不同区域均为优势种。底栖动物平均密度和生物量在5月份处于峰值，远高于8月和10月，多样性指数不具有显著的时空差异（P>0.05）。塔里木河干流和车尔臣河摄食功能群主要以收集者为主（95.89%,91.86%），而台特玛湖则以收集者（50.68%）和捕食者（34.12%）为主。Mantel相关性分析结果显示，氨氮、溶解氧和高锰酸钾是影响底栖动物多样性和功能群的主要环境因子。调查结果表明塔里木河流域底栖动物群落组成较为单一，生态环境较为脆弱，需继续开展并深化对该地区河流的生态修复和管理工作。