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黄颡鱼硒蛋白3个基因的克隆与分析

2023-08-18分类号:S917.4

【作者】刘光辉  余岸艮  何杨  郭雨诗  柯江  罗智  
【部门】华中农业大学水产学院  华中农业大学深圳营养与健康研究院  中国农业科学院深圳农业基因组研究所和岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心  
【摘要】为探讨黄颡鱼硒蛋白selenow2a、selenop2和selenot2基因之间的关系,采用3'/5'RACE PCR克隆得到3个基因的cDNA全长,分别为891、1998和1432 bp,其中ORF长度分别为288、828和600 bp,编码95、275和219个氨基酸。在线工具SECISerach3对3个基因的cDNA序列分析结果显示,它们都含有可以编码硒代半胱氨酸的终止密码子,以及在3'非编码区存在SECIS元件。通过比对氨基酸序列和分析系统发育树,selenow2a、selenop2和selenot2基因预测得到的氨基酸序列与斑马鱼(Danio rerio)进行比较发现氨基酸同源性分别为82.24%、66.19%和79.45%,而与斑点叉尾鮰(Ictalurus punetaus)的氨基酸同源性分别为94.74%、68.50%和90.95%,在发育树上则显示为树杈相接近。实时荧光定量PCR被用于检测3个硒蛋白基因的mRNA在黄颡鱼心、肝、肌肉、脑、肠、脾、精巢和卵巢组织中的表达,结果显示其mRNA表达水平呈现组织特异性。表明3个基因拥有硒蛋白家族的特征,但在组织表达上具有特异性。
【关键词】硒蛋白  基因克隆  分子特征  黄颡鱼  组织表达
【基金】华中农业大学深圳营养与健康研究院项目(SZYJY2023016);; 国家重点研发计划“蓝色粮仓”科技创新专项(2018YFD0900400)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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