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赤水乌骨鸡PPP3CA基因多态性与生长性状关联分析

2023-05-23分类号:S831

【作者】周迪  蒋桂荣  欧仁  谢艳  李波  王燕  杨蓉  李俊  沈银  敖叶  王昌毅  
【部门】贵州省种畜禽种质测定中心  贵州省畜禽遗传资源管理站  
【摘要】【目的】探究PPP3CA基因对赤水乌骨鸡生长性状的影响,为赤水乌骨鸡的遗传改良、分子育种提供依据。【方法】以赤水乌骨鸡为研究对象。采用PCR扩增和直接测序技术对其PPP3CA基因全部外显子进行多态位点筛选,运用RNAfold WebServer和Structural Bioinformatics Group在线软件预测PPP3CA蛋白质二级结构和三级结构,计算基因频率、基因型频率、纯合度、杂合度、有效等位基因数和多态信息含量,并对HardyWeinberg平衡状态进行分析;采用SPSS对不同多态位点所对应的基因型与体尺指标进行相关性分析。【结果】在外显子7处发现C29T、T50C和T63G共3个错义突变位点,外显子16处发现1个错义突变位点G720A;χ~(2)检验表明上述几个基因座均偏离Hardy-Weinberg平衡状态;C29T位点突变的CC型显著提高个体的体重、骨盆宽和胸围;T50C位点突变的CC型显著提高个体的体重、胫长和龙骨长;T63G位点的TT型显著提高个体的胫长和龙骨长;G720A位点的AA型极显著提高个体的胫长和龙骨长,CC型显著提高个体的体斜长。C29T位点的CC型、T50C位点的CC型、T63G的TT型和G720A位点的AA型均为优势基因型,但C29T和T50C位点碱基突变为不利突变,而T63G和G720A位点的突变为有利突变,且G720A位点更有利于赤水乌骨鸡生长,可作为赤水乌骨鸡分子标记辅助选育参考位点。【结论】本研究首次探讨PPP3CA基因与鸡生长性状的相关性,并在家鸡的PPP3CA基因外显子中发现4个多态位点,表明PPP3CA基因对赤水乌骨鸡生长性状具有一定影响,可作为赤水乌骨鸡分子标记辅助选育参考位点,研究结果可为今后赤水乌骨鸡的遗传改良育种提供参考依据,并为进一步研究鸡PPP3CA基因奠定了基础。
【关键词】赤水乌骨鸡  PPP3CA  生长性状  多态性  差异显著
【基金】中央引导地方发展专项资金项目“贵州省种畜禽遗传资源检测平台建设”[黔科中央地(2018)4015];; 贵州省地方家禽产业联合攻关项目“贵州省地方鸡品质特性研究及示范应用”[黔财农(2020)175];; 贵州省生态家禽产业技术体系建设“贵州地方鸡种质资源高效保护关键技术研究”[黔财农(2022)162]
【所属期刊栏目】西南农业学报
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