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乌菜BcVIL2基因克隆及春化响应表达分析

2023-07-21分类号:S634.4

【作者】桂尚枝  刘雪晴  王英  唐小燕  赵龙龙  李广  吴思文  温宏伟  汪承刚  陈国户  
【部门】安徽农业大学园艺学院蔬菜遗传育种实验室/安徽省园艺作物育种工程实验室  安徽省皖江蔬菜产业研究院  
【摘要】【目的】从乌菜(Brassica campestris L.)中克隆VIN3-LIKE 2 (VIL2)基因并进行生物信息学与表达分析,为进一步研究BcVIL2基因功能奠定基础。【方法】以‘徽乌19’为试验材料,利用同源克隆等技术获得BcVIL2基因,对其序列进行蛋白分子量(MW)、糖基化位点、二级结构等生物信息学分析;利用荧光定量PCR等技术分析其应答春化表达模式。【结果】BcVIL2基因ORF (Open reading fragment)全长为1296 bp,共编码431个氨基酸,属于亲水性蛋白,预测含有1个潜在的糖基化位点和59个潜在的磷酸化位点,蛋白分子量为47.91 kDa,理论等电点(pI)为8.27;其二级结构主要由α-螺旋与无规则卷曲组成;亚细胞定位预测其可能在细胞核中发挥作用;同源序列比对分析显示该基因与芸薹属植物VIL2基因同源性较高;亲缘进化树分析也显示该基因与白菜(B. rapa, syn. B. campestris)和芥菜(B. juncea) VIL2基因亲缘关系很近;荧光定量PCR结果表明,盛花期时BcVIL2基因在根中表达量最低,在荚中表达量最高,而叶中表达量显著低于茎和花中表达量;一月苗龄植株春化后BcVIL2基因的表达量显著低于未春化时的表达量。【结论】乌菜VIL2基因响应春化负表达,与春化反应相关基因BraA01g032910.3C、BraA05g026410.3C与BraA10g016160.3C密切相关,可能存在互作关系,本研究结果为深入分析BcVIL2基因的功能提供了良好基础。
【关键词】乌菜  VIL2  春化  基因克隆  表达分析
【基金】安徽高校自然科学研究重点项目(2022AH050913);; 国家自然科学基金项目(31801853);; 国家留学基金委访问学者项目(202008775006)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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