【摘要】多鳞四指马鲅（Eleutheronema rhadinum）是一种名贵经济鱼类，具有较好的养殖开发前景。本文采用fAFLP对多鳞四指马鲅8个地理群体214个样本进行扩增和遗传结构分析。结果显示：9对引物组合共扩增条带493条，多态性条带为443条，多态性比例为89.86%；8个地理群体Nei’s基因多样性指数为0.3028±0.1253，Shannon’s信息指数为0.4378±0.1480。多态性位点数、多态性位点比例、有效等位基因、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数表明，群体遗传多样性大小依次为舟山（ZS）>崇明（CM）>启东（QD）>东山（DS）>广州（GZ）>湛江（ZJ）>琼海（QH）>高雄（GX）。经AMOVA分子方差分析，23.72%遗传变异来自于群体间，基因流Nm为0.8040。8个地理群体UPGMA聚类得出多鳞四指马鲅群体可划分为4分支。研究不同地理群体多鳞四指马鲅的遗传结构，以期为合理地评估和保护其资源、开展遗传育种及开发人工养殖技术等提供基础资料。