基于线粒体COI序列的江淮下游湖泊鲢群体遗传多样性和遗传结构分析
2023-07-15分类号:S917.4
【部门】江苏省淡水水产研究所江苏省内陆水域渔业资源重点实验室 南京师范大学海洋科学与工程学院 中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室
【摘要】本研究采用线粒体COI序列为分子标记,探究了长江、淮河下游8个湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)群体的遗传多样性和遗传结构。通过PCR和测序技术,获得鲢COI基因序列片段。分析结果显示:COI序列片段长度为630 bp, 243条COI序列共检出23个变异位点,定义14种单倍型,平均单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(P_i)分别为0.692和0.005 12。8个群体的单倍型多样性为0.508~0.803,核苷酸多样性为0.002 41~0.006 94,表明鲢群体的遗传多样性有较大差异。分子方差分析结果显示,遗传变异主要来自于群体内,遗传分化指数(F_(ST))为0.008 3,表明群体间没有显著遗传分化。系统发育树和网络结构图显示,单倍型分化为2个分支,但群体没有形成特定的地理遗传结构。中性检验结果和歧点分布曲线表明,鲢群体没有显著偏离中性选择,群体大小保持相对稳定。
【关键词】鲢(Hypophthalmichthys molitrix) COI基因 遗传多样性 遗传结构
【基金】2020年省级单位项目“渔业生态监测(2020-SJ-016-2)”;; 2021年省级单位项目“渔业生态与资源监测(2021-SJ-110-03)”
【所属期刊栏目】淡水渔业
文献传递