基于分子标记共祖的亚东鲑育种群体遗传背景分析
2023-07-15分类号:S917.4
【部门】河南农业大学动物科技学院 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
【摘要】为明确亚东鲑(Salmo trutta fario)育种群体遗传背景,为今后亚东鲑的育种工作及家系选育提供理论依据,本研究通过分子标记共祖技术,对雅鲁藏布江渔业资源繁育基地的245尾亚东鲑育种群体的遗传背景进行了分析。结果显示:245个个体被分为6个群体,StfA1、StfC2和StfC3群体中多数个体来源于不同祖先,StfB1、StfC1和StfC4群体中多数个体具有单一的祖先来源;245个个体中基因组近交系数大于0.062 5的个体比例为19.6%(48/245),其中StfA1群体为36.3%(37/102),StfC2群体为5.9%(3/51),StfC3群体为4.3%(2/47),StfC4群体为50%(6/12);基因组近交系数大于0.125的个体有14个,基因组近交系数大于0.25的个体有1个;6个群体内共有115对个体为全同胞近交类型(CC≥0.25),958对个体为半同胞、祖孙或叔侄近交类型(0.125≤CC<0.125);6个群体间个体亲缘关系无全同胞近交类型,半同胞、曾孙或叔侄近交类型的个体对为101对;堂兄妹、半叔侄或曾祖孙近交类型的个体对为584对;基因流结果表明StfC3群体和StfC4群体基因交流最大,流向为StfC4群体到StfC3群体,其余各种群间也存在相当程度的基因交流。该亚东鲑繁殖群体遗传多样性水平较低,可能存在一定的种质衰退。StfC1、StfC2、StfC3和StfC4四个群体两两间均达到了近亲繁殖的程度,在今后的亚东鲑育种过程中可做为一个家系使用。
【关键词】亚东鲑(Salmo trutta fario) 分子标记共祖 遗传结构 遗传多样性 亲缘关系
【基金】西藏自治区外国专家项目(2020WZ007);; 西藏自治区重点研发计划(XZ202101ZY0003N);; 国家特色淡水鱼产业技术体系(CARS-46);; 西藏自治区中央引导地方项目(XZ202001YD0022C,XZ202201YD0023C);; 西藏地区经济鱼虾循环水养殖技术集成和示范(2022ZX10,XZ202101ZY0003N)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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