【摘要】【目的】为揭示高寒地区不同植被类型土壤有机碳稳定性的分子机制。【方法】以西藏东南部色季拉山森林和草地为研究对象，采用傅里叶变换红外光谱法分析不同层次（0～10、10～20、20～30、30～40和40～50 cm）土壤主要有机碳分子构成特征。【结果】1）色季拉山高寒森林和草地土壤有机碳以糖类碳为主，平均峰强度分别为1.13和0.80，其次为脂肪族甲基（CH3）和亚甲基（CH2），芳香族碳含量相对较低，森林和草地土壤峰强度平均值分别为0.26和0.22;2）土壤有机碳分子构成呈现出明显的层次特征，主要集中在表层0～20 cm，下层则相对含量下降；3）植被类型显著影响了土壤主要有机碳分子的构成，各层次土壤有机碳分子均表现为森林>草地，且糖类碳差异最大，5个土壤层次峰吸收强度差值分别为0.34、0.36、0.31、0.09和0.56;4）土壤脂肪碳/芳香碳比在0～30 cm层次表现为森林>草地，而30～40和40～50 cm层次土壤为草地>森林，即森林表层土壤有机碳化学稳定性较草地低，而下层则具有更强的化学稳定性；5）土壤脂肪族碳、芳香族碳含量与总有机碳之间显著正相关，与易氧化有机碳之间呈显著幂函数正相关关系（P <0.05），而糖类碳与总有机碳和易氧化有机碳之间相关性均不显著。【结论】高寒生态系统森林、草地土壤有机碳分子化学构成及稳定性不同，可能直接影响土壤有机碳的周转速率。