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基于SSR标记的白蜡群体遗传多样性和群体结构分析

2023-06-20分类号:S792.41

【作者】高铖铖  燕丽萍  吴德军  王因花  
【部门】山东省林业科学研究院山东省林木遗传改良重点实验室  
【摘要】【目的】白蜡是北方重要的盐碱地造林树种,了解白蜡居群的遗传多样性和群体结构对于白蜡种质资源的有效保护和开发利用至关重要。【方法】利用筛选的SSR标记,对来自9个不同地理区域的共380份白蜡种质资源进行遗传分化分析、分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析。【结果】12对SSR引物在所有白蜡中都能进行扩增,等位基因(N_a)共51个,平均每对引物观察到4.287个等位基因,PIC为0.119 7~0.750 9,平均为0.532 9,高于0.5;白蜡居群的群体内近交系数(F_(is))平均为0.016,群体近交系数(F_(it))平均为0.091,显示杂合频率高,居群近交较多,群体分化率(F_(st))平均为0.095,存在中度程度的遗传分化,基因流(N_m)平均为4.199,居群间基因交流非常丰富;AMOVA分析结果表明9个白蜡居群的遗传差异主要来源于个体间(91%);群体结构分析结果显示,9个来自不同地理区域的白蜡居群中存在3个不同的基因库,居群间在进化上相对独立,存在一定程度的遗传混合,遗传组分相对单一,与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。【结论】12个SSR标记多态性较好、稳定性较高,能有效鉴别来自9个不同地理区域白蜡居群的380份种质资源,并揭示种质的遗传多样性和群体遗传结构,可为白蜡的种质保存和育种提供有价值的科学依据。
【关键词】SSR标记  白蜡  遗传多样性  群体结构
【基金】国家重点研发计划项目“北方珍贵林木新品种选育”(2021YFD22003030109);; 山东省自然科学基金项目“盐诱导的FvCAMTA1转录因子调控绒毛白蜡耐盐的机制研究”(ZR2022MC090);; 泰山学者工程项目资助
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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