【摘要】部门整体支出绩效评价是全面实施预算绩效管理的重要组成部分，也是进一步深化预算绩效管理改革的方向。通过剖析当前部门整体支出绩效评价的理论演进与操作实务，发现依然存在“碎片化”等问题，未能充分体现促进部门整体效能提升的功能作用。借鉴共生理论以实现复杂系统和谐统一为目标的理念，能很好实现部门整体支出绩效评价的“整体性”理念。因此，进一步融合共生理论设计部门整体支出绩效评价方案，并以福建省交通运输厅为典型案例验证评价方案的可操作性，对优化部门整体支出绩效评价具有启示意义。