【摘要】为阐明长江干流轮虫群落结构与分布特征及其环境影响因素，本研究基于水体物理化学参数将长江干流自源头至下游共27个江段的生境空间划分为4个区域：高山区、峡谷区、平原区、河口区，探究各区域轮虫群落结构特征与分布规律，并基于生物学方法评价了长江干流各区域水质现状。结果显示：研究期间在长江干流共鉴定出轮虫37属85种，其中包括指示种63种，以寡污型种类为主。4个研究区域共有优势种12种，其中曲腿龟甲轮虫（Keratella ualga）、螺形龟甲轮虫（Keratella cochlearis）在多个水域均占优势。长江干流轮虫平均密度为19.66 ind./L，平均生物量为0.11 mg/L。轮虫密度与生物量分布规律均表现为峡谷区>平原区>高山区>河口区。干流平均Shannon-Wiener多样性指数值为2.62,Pielou均匀度指数值为0.78。其中，各区域之间Shannon-Wiener指数表现出显著性差异（P<0.05），而各区域Pielou指数分布相对均匀。非度量多维尺度分析结果显示，峡谷区与平原区轮虫群落相似性较其他区域高。冗余分析结果显示，温度、藻密度、溶氧、总磷等是影响长江干流轮虫空间分布的重要因素。以上研究表明，长江干流不同区域间轮虫群落结构呈现较高的空间异质性，自然环境的变化和人类活动干扰共同影响了轮虫的空间分布。