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牛呼吸疾病综合征七病原联合检测多重qPCR方法的建立

2023-03-09分类号:S858.23

【作者】徐恩红  祁明普  项志杰  胡长敏  陈颖钰  陈建国  陈曦  郭爱珍  
【部门】华中农业大学动物医学院  农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室  湖北洪山实验室  湖北省兽医流行病学国际科技合作基地/农业农村部兽用诊断制剂创制重点实验室/农业农村部反刍动物生物制品重点实验室  
【摘要】为了提高牛呼吸疾病综合征多病原混合感染的临床诊断效率,以牛支原体(Mycoplasma bovis,M.b)oppD/F基因、多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,P.m)ompH基因、溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica,M.h)gcp基因、牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)gB基因、牛呼吸道合胞体病毒(bovine respiratory syncytial virus,BRSV)以及牛副流感病毒(bovine parainfluenza virus type,BPIV) 3型a和c基因型(BPIV-3a,-3c)的N基因等为检测靶标,分别设计特异性引物和Taqman探针,通过优化反应条件,采用3管7联的组合方式建立了7种病原体的多联实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法仅对本试验的7种病原有特异性反应,与其他常见病原无交叉反应。对M.b、P.m、M.h、IBRV、BRSV、BPIV-3a和BPIV-3c质粒标准品的最低检测限分别为10~2、10~2、10~1、10~2、10~2、10~2和10~1拷贝/μL。组内变异系数小于2.5%,组间变异系数小于5.5%。平行应用该方法和常规PCR方法对临床采集的115份有呼吸道症状牛的鼻拭子进行检测,P.m阳性率36.65%,M.b阳性率27.83%,M.h阳性率25.22%,IBRV阳性率11.30%,BPIV-3c阳性率8.57%,BRSV阳性率0.95%;其中混合感染率为26.1%。共检测到11种混合感染模式,主要由M.b与其他病原体的混合感染,占72.7%(8/11);M.b/P.m混合感染的检出率最高,占60%(18/30);M.b、P.m、M.h在混合感染中出现率排前三,其占比分别为73.3%(22/30)、73.3%(22/30)和43.3%(13/30);其次为IBRV,占26.7%(8/30); BPIV-3c占13.3%(4/30)。以上结果表明,该方法具有较高的分析敏感性和特异性,可用于牛呼吸疾病综合征多病原感染的联合检测。
【关键词】多联实时荧光定量PCR方法  牛呼吸疾病综合征  混合感染  牛支原体  多杀性巴氏杆菌  牛溶血性曼氏杆菌  多病原联合检测
【基金】宁夏回族自治区重点研究发计划项目(2021BEF02028);; 国家现代农业产业技术体系(肉牛/牦牛)专项(CARS-37);; 湖北省重点研发计划项目(2020BBA055)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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