巨菌草(Cenchrus fungigraminus)全基因组CAMTA家族转录因子的鉴定及进化分析
2023-01-18分类号:S54
【部门】福建农林大学生命科学学院 福建农林大学国家菌草工程技术研究中心 福建农林大学海峡联合研究院
【摘要】采用生物信息学方法鉴定了巨菌草(Cenchrus fungigraminus Z. X. Lin&D.M. Lin&S. R. Lan sp. nov.)中CAMTA(calmodulin-binding transcription activator)转录因子的家族成员,并对其蛋白序列的理化性质、基因结构、保守基序、保守功能结构域、系统进化发育关系、启动子区域顺式作用元件进行了分析;探讨了巨菌草CAMTA((CfuCAMTA))家族成员在干旱胁迫下转录水平的变化,以及CfuCAMTA转录因子对响应干旱胁迫的影响.结果表明:巨菌草CAMTA家族共有15个成员,其中仅CfuCAMTA10和CfuCAMTA11较为稳定,不稳定系数小于40;多数成员为不稳定蛋白质;巨菌草和紫象草CAMTA基因的亲缘关系最近;4个CAMTA转录因子的表达水平随干旱时间的延长,在第14天表达量达到最大,说明这些CAMTA参与了干旱胁迫的响应.
【关键词】巨菌草 CAMTA转录因子 全基因组鉴定 进化分析 干旱胁迫
【基金】福建农林大学学科交叉融合专项(XKJC-712021030);; 福建省科技计划重大专项(2021NZ029009);; 福建省自然科学基金杰出青年项目(2022J06017)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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