龙眼GH3家族成员的全基因组鉴定及表达分析
2023-03-18分类号:S667.2
【部门】福建农林大学园艺植物生物工程研究所
【摘要】为探究龙眼GH3基因家族结构特征及表达模式,基于龙眼基因组及转录组数据库对DlGH3基因家族进行鉴定.共鉴定出10个DlGH3家族成员,分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),均含有GH3保守结构域.启动子序列预测显示,DlGH3含多个与激素响应、光响应、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件.转录组数据和qRT-PCR的表达谱分析显示,DlGH3在体胚发生早期的表达模式存在差异,DlGH3.5在胚性愈伤组织中的表达量极高,DlGH3.3和DlGH3.6在花、花芽和根中特异性表达;DlGH3不同成员在蓝光、白光和黑暗处理下的表达趋势存在差异.此外,在外源IAA、2,4-D、MeJA、GA_3、ABA和SA处理下,DlGH3成员的表达均被不同程度诱导.因此,DlGH3在进化中具有较高的保守性,可能参与调控龙眼体胚发生、外源激素响应、龙眼开花和根的生长等发育过程.
【关键词】龙眼 GH3基因家族 体胚发生 激素 实时荧光定量PCR
【基金】福建省自然科学基金项目(2021J01086);; 福建省教育厅中青年教师教育科研项目(20201125)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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