小麦、野生二粒小麦、大麦CBF基因家族比较分析
2023-02-21分类号:S512.1
【部门】山东农业大学生命科学学院 南昌工程学院江西省樟树繁育与开发利用工程研究中心
【摘要】CBF(C-repeat-binding factor)是植物响应低温胁迫的主要转录因子.本研究对小麦、野生二粒小麦、大麦CBF基因家族进行了全基因组鉴定和比较分析,并采用生物信息学技术对CBF基因的结构、系统发育、染色体定位、顺式作用元件以及共线性进行了分析,然后利用转录数据分析了该基因在不同胁迫条件下以及不同组织中的表达模式.经鉴定,小麦、野生二粒小麦、大麦CBF基因分别为75、31、19个.CBF基因具有很强的保守性,编码蛋白为亲水蛋白,绝大多数具有单一外显子结构,在第5染色体上集中分布;CBF基因家族存在片段串联重复和染色体倍加现象;不同CBF基因具有不同顺式作用元件.在不同胁迫条件下CBF基因表达水平不同,不同组织中的CBF基因表达水平也不同.由此推测CBF基因结构和功能出现分化可能是植物对不同环境的自适应结果,片段串联重复和染色体倍加是CBF基因家族扩张的驱动力.
【关键词】小麦 野生二粒小麦 大麦 CBF基因家族 生物信息学分析
【基金】江西省林业局樟树研究专项([2020]07);; 江西省科学技术厅重大科技研发专项(20203ABC28W016)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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