【摘要】针对重大工程供应链中多主体协同合作利益分配以及创新决策问题，考虑到两阶段博弈中决策的不同情形，应用非合作-合作混合的双体博弈方法进行了研究。通过模型构建与求解得到各主体的最优创新努力和收益以及整个系统的最优收益，并在此基础上拓展模型，分析成本补贴机制和垂直整合机制两种激励机制对各主体最优创新努力、收益和供应链系统收益的影响。研究发现重大工程多主体协同合作中存在创新投入不足的情况，导致供应链系统收益偏低；创新成本补贴机制以及垂直整合机制能够有效激励参与主体的创新积极性；成本补贴机制能够提高各主体以及整个供应链系统的收益，垂直整合机制对收益的影响主要取决于整合成本的区间范围。