基于RNA-seq的番茄响应根结线虫MiPDCD6蛋白的SA信号通路基因鉴定与表达分析
2023-02-28分类号：S436.412.19
【部门】华南农业大学植物保护学院广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室
【摘要】为了揭示南方根结线虫MiPDCD6蛋白抑制番茄PTI免疫的分子机理，以番茄品种新金丰1号MiPDCD6超表达苗为试验材料，以番茄品种新金丰1号组培苗为对照，通过转录组测序技术分别对番茄MiPDCD6超表达苗和对照苗进行转录组测序。以番茄栽培品种Heinz 1706基因组作为参考基因组进行对比，利用FPKM法计算基因表达量，设定参数(|log_2 FC|>1且P
【关键词】番茄 根结线虫 转录组 差异表达基因 SA信号通路 MiPDCD6
【基金】广东省基础与应用基础研究基金(2019A1515012080);; 国家自然科学基金项目(31171825;30771409)
【所属期刊栏目】华北农学报
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