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瘤背石磺NR1基因的克隆和序列分析以及低频声音刺激对其表达的影响

2023-02-21分类号:S917.4

【作者】钱畅  肖海明  陈锡林  张小明  土志涵  沈和定  
【部门】上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心  上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心  上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室  
【摘要】长期栖息于潮间带的瘤背石磺能感知潮汐来临时产生的低频声音,本研究模拟潮汐的低频声音刺激瘤背石磺,探讨NR1型受体基因在瘤背石磺感应低频声音的行为中发挥的作用。首先通过cDNA末端扩增法(RACE)得到瘤背石磺NR1基因(OrNR1)cDNA全长,进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测OrNR1基因在各组织以及不同低频声波刺激下神经节中的表达。结果显示,OrNR1基因全长2 434 bp,其中5'非编码区 (UTR) 长357 bp, 3'UTR长184 bp,1 893 bp开放阅读框共编码630氨基酸。瘤背石磺OrNR1蛋白分子量约为70.29 ku,等电点为5.93,分子式为C_(3153)H_(4911)N_(833)O_(924)S_(32)。OrNR1基因含有信号肽,一个预测的甘氨酸和谷氨酸结合位点,一个跨膜域,多序列比对结果表明各物种间NR1具有较高的保守性,系统进化树结果显示瘤背石磺OrNR1基因与加州海兔亲缘关系最高,符合传统形态学分类。qRT-PCR结果显示,OrNR1在瘤背石磺不同组织均有表达,在神经节中相对表达量最高,其次是肝胰腺、腹足,而在口器和背部皮肤中表达量较低OrNR1在频率为200、160 Hz的低频声音刺激下表达量在不同时间组均显著高于对照组,40 Hz的低频声音刺激下2 h后表达量显著高于对照组;在120 Hz时OrNR1基因表达量受到抑制,不同组的表达量有显著差异。推测该基因在瘤背石磺低频声音感知中起到了重要作用。
【关键词】瘤背石磺  OrNR1  低频声波  潮汐节律  基因克隆
【基金】上海市协同创新中心任务团队经费(A1-3605-21-000202)
【所属期刊栏目】水产学报
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