杜仲WOX家族基因鉴定及在叶片发育中的表达
2023-01-16分类号:S567.19
【部门】河南中医药大学中医药科学院河南省中医方证信号传导重点实验室 国际竹藤中心国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室 国际竹藤中心安徽太平试验中心 西北农林科技大学林学院 河南中医药大学药学院
【摘要】【目的】Wuschel (WUS)相关的同源异型盒(Wuschel-related homeobox,WOX)转录因子家族在植物生长发育中发挥重要作用。本研究旨在探索WOX转录因子在杜仲Eucommia ulmoides中的分布及表达特征。【方法】以杜仲基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对杜仲WOX家族进行全基因组鉴定;基于转录组数据分析EuWOXs在叶片发育及杜仲胶形成中的表达特征,通过实时荧光定量PCR (RT-qPCR)检测EuWOXs在‘紫叶’杜仲‘Ziye’叶片不同发育时期的表达模式。【结果】杜仲基因组中共鉴定出8条EuWOXs,分布于8条染色体;EuWOXs蛋白质长度为182~352个氨基酸,理论等电点为5.10~6.47,分子量为20.7~40.4 kDa;亚细胞定位预测EuWOXs均定位在细胞核中,均为亲水性蛋白。根据系统进化关系,杜仲WOX家族包括3个亚家族,分别含2、1和5个EuWOXs基因。EuWOXs均含有内含子,并包含多个基序,启动子中富含激素、胁迫和光周期响应元件。大部分EuWOXs在杜仲叶片中表达量较低,EuWOX13-1随叶片发育表达量逐渐降低,EuWOX13-2在生长叶中表达量最高。【结论】杜仲中有8个EuWOXs基因,EuWOX13-1和EuWOX13-2可能在杜仲叶片发育中发挥重要作用。图10表2参50
【关键词】杜仲 WOX家族基因 生物信息学分析 基因表达 叶片发育
【基金】河南省科技研发计划联合基金项目(222301420074);; 河南省高等学校重点科研项目(22A360005);; 国际竹藤中心安徽太平试验中心开放课题基金(1632021006-4);; 国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室开放基金(ICBR-2020-05);; 河南中医药大学博士科研启动基金项目(RSBSJJ2019-04)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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