标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

不同组织及干旱胁迫下黄薇内参基因的筛选与验证

2023-03-01分类号:S685.99

【作者】赵雨  林琳  王群  张国哲  王杰  尚林雪  洪思丹  马清清  顾翠花  
【部门】浙江农林大学风景园林与建筑学院  浙江农林大学浙江省园林植物种质创新与利用重点实验室  浙江农林大学南方园林植物种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室  
【摘要】【目的】为黄薇Heimia myrtifolia不同组织及不同干旱胁迫下基因表达分析筛选最适内参基因。【方法】选取黄薇盛花期的根、茎、叶、花,以及5种不同干旱处理的叶片作为实验材料,借助RT-qPCR技术对黄薇转录组数据筛选的9个候选内参基因进行分析,并利用软件geNorm、BestKeeper、NormFinder和RefFinder综合评价候选基因的表达稳定性。最后选取2个与胁迫相关的基因CSLD和SOD,对所选内参基因进行验证。【结果】geNorm、BestKeeper和NormFinder分析得出的候选内参基因排序存在一定差异。利用在线软件RefFinder对上述3个软件的结果综合分析得出:在不同组织中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为TUA;在干旱胁迫中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为TUB。在全部样本中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为18S RNA。对不同组织和干旱胁迫下的CSLD和SOD基因表达模式进行验证表明:上述2个基因与筛选所得内参基因的表达量和变化趋势均较为一致。【结论】在不同组织和干旱处理后,GAPDH是最适合黄薇基因表达的内参基因。图4表4参33
【关键词】黄薇  实时荧光定量PCR  内参基因
【基金】浙江省农业新品种重大专项花卉育种专项(2021C02071-4);; 浙江省自然科学基金资助项目(LY21C160001)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
文献传递