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柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选

2023-01-03分类号:S682.29

【作者】梁蕤  徐雷锋  毕蒙蒙  王静  唐玉超  郝泽慧  刘一洁  杨盼盼  明军  杜方  
【部门】山西农业大学园艺学院  中国农业科学院蔬菜花卉研究所  北京农学院园林学院  青岛农业大学园林与林学院  山西农业大学城乡建设学院  
【摘要】为筛选柠檬色百合(Lilium leichtlinii)实时荧光定量PCR稳定的内参基因,以柠檬色百合不同发育时期花被片、根、茎、叶和鳞片为试验材料,测定比较总类胡萝卜素含量;使用RT-PCR和荧光定量PCR检测9个候选内参基因(AP4、Actin、β-TUB、CYP、eIF、GAPDH、RH2、UBC和18S)特异性及表达水平,利用geNorm、NormFinder、Bestkeeper、ΔC_T程序和RefFinder网站综合评估候选内参基因表达稳定性;选用八氢番茄红素酶基因PSY对内参基因稳定性进行验证,最终确定合适且稳定的内参基因。结果表明:1)柠檬色百合花被片发育过程中Actin和AP4为9个候选内参基因中最稳定的内参基因,UBC为最不稳定的内参基因。2)柠檬色百合不同器官间eIF和AP4为候选内参基因中最稳定的内参基因,18S为最不稳定的内参基因。3)在柠檬色百合花被片发育过程和不同器官间,以筛选出最稳定的内参基因为参照计算所得PSY基因表达情况与实际测得总类胡萝卜素含量变化趋势一致;以筛选出最不稳定的内参基因作为参照计算所得PSY基因表达情况与总类胡萝卜素含量变化趋势不同甚至相反。研究表明在试验中不能随意使用内参基因,需要在使用前对其进行筛选、评价和验证,同时研究结果为柠檬色百合花被片发育过程和不同器官间基因表达分析提供了稳定的内参基因。
【关键词】柠檬色百合  实时荧光定量PCR  内参基因  类胡萝卜素
【基金】山西省基础研究计划(自由探索类)自然科学研究面上项目(20210302123416);; 国家自然科学基金项目(32172624,31801899);; 山西农业大学横向科技合作项目(2021 NYGG-1-11)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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