韭菜不同生态位微生物群落组成及功能特征
2023-03-14分类号:S154.3;S633.3
【部门】中国农业大学水利与土木工程学院 平顶山市农业科学院 平顶山市平丰种业有限责任公司
【摘要】为探究韭菜(Allium tuberosum Rottl. ex Spreng.)不同生态位微生物的分布情况,通过高通量测序技术,结合生信分析比较不同生态位的多样性差异,找出不同生态位的核心菌群;通过PICRUSt2对不同生态位微生物的功能进行预测。结果表明:韭菜根及根际土,即韭菜的地下部分,微生物群落的丰富度和多样性高于其他生态位,且主要的核心菌群为变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria);而地上部分如韭菜叶片中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度更高。通过对不同生态位韭菜细菌代谢功能进行预测,发现在韭菜地上部位内生菌主要的代谢功能是通过各种有机系统进行一系列代谢活动,而地下部分的微生物主要是参与遗传信息的处理和细胞的基础活动,变形菌门多与细胞的基础生命活动有关,而地上所发挥作用的厚壁菌门和拟杆菌门可能参与韭菜机体的一系列代谢活动。该研究结果为不同品种韭菜内生菌研究提供理论基础。
【关键词】生态位 内生菌 叶际微生物 根际微生物 韭菜 微生物共现网络
【基金】北京市自然科学基金-海淀原始创新联合基金(L212068);; 平顶山市重大科技专项(2020ZD19)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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