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龙岩山麻鸭蛋品质性状的全基因组关联研究

2023-02-01分类号:S834

【作者】孙艳发  吴琼  林如龙  陈红萍  甘秋云  沈玥  王亚茹  薛鹏飞  陈飞帆  刘健涛  周陈鑫  兰诗诗  潘浩哲  邓凡  岳稳  江宵兵  李焰  
【部门】龙岩学院生命科学学院  龙岩学院/福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室/预防兽医学与生物技术福建省高校重点实验室  龙岩市新罗区农业局山麻鸭原种场  福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)  福建省畜牧总站  
【摘要】【目的】通过全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)技术筛选和鉴定鸭蛋品质性状的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点及候选基因,为龙岩山麻鸭蛋品质性状分子育种提供参考。【方法】试验测定产蛋后期235只龙岩山麻鸭母鸭蛋品质性状,包括蛋重(egg weight,EW)、蛋形指数(egg shaped index,ESI)、蛋壳厚(eggshell thickness,EST)、蛋壳强度(eggshell strength,ESS)、蛋壳颜色L*、a*、b*值(eggshell colour L*,a*,b*,ESCL、ESCA和ESCB)、蛋白高度(albumin height,AH)、哈氏单位(Haugh unit,HU)、蛋黄颜色(egg yolk colour,EYC)、蛋黄重(egg yolk weight,EYW)和蛋黄比例(egg yolk percentage relative to egg weight,EYP)。使用ASReml-R 4.1软件多性状动物模型对蛋品质性状进行遗传参数估计。使用简化基因组测序技术对鸭血液基因组DNA进行SNP分型,分型后进行蛋品质性状与这些SNPs间的GWAS研究。【结果】龙岩山麻鸭蛋品质性状中,EW、ESI、EST、ESL、ESA和AU具有中高等的遗传力,遗传力在0.21—0.70之间。EW与AU存在较强的正遗传相关(r_g=0.91±0.37)。ESI与EYC存在较强的遗传负相关(r_g=-0.98±1.03)。EST与ESS具有表型正相关(r_p=0.41±0.06),与ESA具有遗传和表型负相关(r_g=-0.86±0.25和r_p=-0.15±0.07),与ESB具有遗传和表型正相关(r_g=0.96±0.37和r_p=0.18±0.07)。ESA与ESB具有遗传和表型负相关(r_g=-0.64±0.28和r_p=-0.31±0.06)。GWAS研究结果表明,7个SNPs位点与ESI、EST和EYC达到5%基因组水平显著关联(P
【关键词】龙岩山麻鸭  蛋品质  遗传参数  单核苷酸多态性  全基因组关联研究
【基金】福建省种业创新与产业化工程(2021-2025);; 农业良种重大科研育种攻关与产业化工程项目(zycxny20211014);; 福建省科技厅对外合作项目(2021I0045);福建省科技厅引导性科技项目(2020N0034);; 龙岩学院科研博士启动基金(LB2019001)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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