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马氏珠母贝Rab7基因序列特征及其与耐低温性状的关系

2022-09-15分类号:S917.4

【作者】宋欣霖  杨佳雯  韩书雅  赖卓欣  王庆恒  邓岳文  
【部门】广东海洋大学水产学院  广东省珍珠科技创新中心  广东省海水养殖生物育种工程实验室  广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室  
【摘要】Rab蛋白是膜泡运输过程中的重要调节因子,在囊泡运输和水产动物的免疫应答中行使重要功能。本研究鉴定了马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)的Rab7基因(Pm-Rab7),分析了Pm-Rab7在6个组织中和温度胁迫(低温组17℃、对照组22℃、高温组32℃)下的表达模式,筛选和比较分析了马氏珠母贝耐低温选育系(low temperature resistant line, R) F_(3)和北部湾野生群体(Beibu Gulf wild population, W)的Pm-Rab7外显子区的SNP位点。结果显示:Pm-Rab7序列全长为1153 bp,5′端、3′端和开放阅读框(ORF)序列长度分别为30、505和618 bp,共编码205个氨基酸;Pm-Rab7具有一个RAB保守结构域,并与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)相似度最高,为92.79%。系统进化树结果显示,Pm-Rab7与太平洋牡蛎等软体动物聚为一支。Pm-Rab7在所检测的组织都有表达,其中在性腺和鳃中的表达显著高于外套膜和肝胰腺等其他组织(P0.05);说明该基因的表达与马氏珠母贝对低温胁迫的响应密切相关。Pm-Rab7基因的外显子区域在R和W中共检测到7个SNP位点,其中3个位点的基因型频率在2个群体间具有显著性差异,说明这些位点可能与马氏珠母贝耐低温性状相关。结果表明,Pm-Rab7可能在马氏珠母贝耐低温适应过程中发挥重要作用,研究结果可为深入探讨马氏珠母贝对温度变化胁迫的环境适应性研究提供参考资料。
【关键词】马氏珠母贝  Pm-Rab7  基因克隆  温度胁迫  SNP
【基金】广东省自然科学基金项目(2020A151501691);; 广东省教育厅重点领域专项(2020ZDZX1045);; 广东省现代农业产业技术体系–贝藻类产业创新团队(KJ146)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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