松材线虫VAP家族成员结构分析
2022-09-18分类号：S763.18
【部门】国家林业和草原局生物灾害防控中心/林业有害生物监测预警国家林业和草原局重点实验室 东北林业大学林学院 荣成市国有成山林场
【摘要】类毒液过敏原蛋白(VAP)是一类高度保守的线虫分泌物，在线虫侵染寄主植物早期发挥重要作用.运用生物信息学方法在松材线虫(Bx)基因组中共鉴定出14个VAP家族成员，对其理化性质、保守基序和二、三级结构等生物学特性进行分析，并构建了系统发育进化树.结果显示：不同Bx-VAPs的氨基酸组成数量和相对分子质量存在很大差异；14个Bx-VAPs基因的进化相对保守，所有蛋白均含有代谢产物活化蛋白(CAP)结构域；该家族成员有明显的胞外蛋白形态特征，属于分泌蛋白.研究结果可为揭示松材线虫入侵、定殖和致病的机制奠定一定理论基础.
【关键词】松材线虫病 VAP基因家族 蛋白质结构 生物信息学
【基金】国家重点研发计划项目(2021YFD1400900);; 国家林业和草原局重大应急科技项目(ZD202001)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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