基于分子对接技术筛选水稻黄单胞菌CSE抑制剂
2022-09-27分类号:TQ450.1
【部门】沈阳化工大学功能分子研究所 硼镁资源开发与精细化工技术国家地方联合工程实验室 沈阳化工大学制药与生物工程学院 辽宁省绿色功能分子设计与开发重点实验室 沈阳化工大学环境与安全工程学院
【摘要】由水稻黄单胞菌(Xoo)引起的水稻白叶枯病通常会给水稻带来严重危害;由于抗生素类药物的广泛使用,Xoo出现了耐药性。细菌通过体内的胱硫醚-γ-裂解酶(CSE)产生内源性硫化氢(H_(2)S)是其增强耐药性的重要方式。为降低Xoo的耐药性,基于分子对接技术,以Xoo体内的CSE为靶标,从68个吲哚类生物碱中虚拟筛选CSE抑制剂。结果显示,化合物1-hydroxyrutaecarpine、indicant和strictosamide对靶蛋白的亲和力分别为-36.40、-35.15和-34.30 kJ·mol~(-1),均低于参考化合物NL3(-33.89 kJ·mol~(-1))。上述化合物的部分结构均能嵌入蛋白活性空腔并与周围氨基酸产生较为稳定的相互作用。由此推测化合物1-hydroxyrutaecarpine、indican及strictosamide可能会对Xoo体内的CSE产生一定的抑制作用。
【关键词】水稻黄单胞菌 胱硫醚-γ-裂解酶 吲哚类生物碱 分子对接 耐药性 靶向
【基金】辽宁省教育厅服务地方项目(LZ2020001);; 辽宁省教育厅基础研究基金项目(LJ2020026、LQ2019010);; 辽宁省科技厅面上项目(2021-MS-258)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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