【摘要】以线粒体Cyt b基因作为分子标记对雅鲁藏布江中游10条支流中短尾高原鳅(Triplophysa brevicauda)的遗传多样性、遗传分化及种群历史动态进行分析。结果显示：125尾个体中共检测到52个单倍型，各群体的单倍型多样性(0.600～0.900)与核苷酸多样性(0.001 87～0.019 65)普遍处于较高水平。基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示所有单倍型可被划分为5支谱系，各单倍型多为单一群体独享，群体间共享单倍型极少；不同谱系内各地理群体所属单倍型混杂分布，不符合群体的地理分布格局。群体间遗传分化指数检验结果表明多数地理群体间存在高度分化；分子方差分析显示组群间的遗传变异占总变异的39.51%,遗传分化水平为极显著。中性检验和错配分析表明短尾高原鳅总体和部分支流群体历史上发生过种群扩张。贝叶斯天际图进一步推断出短尾高原鳅总体在较近的历史时期(约1.12 kya)经历过快速的种群扩张和收缩，推测其种群动态受到了全新世以来青藏高原南部气候波动及水系变迁的影响。