单细胞转录组测序技术发展及其在甘薯中的应用
2022-09-06分类号:S531
【部门】仲恺农业工程学院农业与生物学院 广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室 华南农业大学植物保护学院
【摘要】单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是在单个细胞水平通过对mRNA进行高通量测序研究其整体水平基因表达情况的一项新技术。本研究概述了scRNA-seq技术的发展历程和创新;详细介绍了scRNA-seq技术的单细胞捕获/分选、反转录/PCR扩增、建库测序和测序数据基础分析等步骤,以及在植物单细胞图谱、非生物胁迫响应机制、细胞分化发育、转录因子调控网络等研究中的应用;剖析了该技术在甘薯中单细胞图谱、分化、抗逆和基因方面的应用潜力;最后对该技术的应用进行了展望。
【关键词】单细胞转录组测序 甘薯 细胞异质性
【基金】广东省重点领域研发计划项目(2020B020219001);; 国家甘薯产业技术体系(CARS-10)资助项目
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
文献传递