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昆明犬IGF1R基因克隆及组织表达分析

2022-07-21分类号:S829.2

【作者】韦云芳  李飞翔  星云  李居东  万九生  陈方良  陈超  
【部门】公安部昆明警犬基地  警犬技术公安部重点实验室  云南农业大学动物科学技术学院  
【摘要】【目的】胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)具有广泛的生物学功能,是研究动物生长发育过程的重要候选因子。本研究旨在探究昆明犬IGF1R基因序列结构特征及其组织表达规律,为深入探讨昆明犬IGF1R基因在生长发育中的调控机理及分子遗传育种的相关研究奠定基础。【方法】基于分子克隆技术对昆明犬IGF1R基因编码区进行扩增和测序,应用生物信息学方法进行序列同源性比对、系统进化树分析,对相应的氨基酸序列进行蛋白理化特性、蛋白结构特征分析,并构建蛋白质三级结构模型。同时利用qRT-PCR方法检测该基因在昆明犬各组织的表达情况。【结果】昆明犬IGF1R基因CDS区长4104 bp,编码1367个氨基酸,其核苷酸序列与家犬(100%)与赤狐(99.3%)的同源性较高,与鸡的同源性较低(78.8%)。IGF1R蛋白分子质量和理论等电点分别为154890 ku和5.58,包含3个纤连蛋白型结构域,1个半胱氨酸富集区和1个酪氨酸激酶结构域,属亲水性跨膜蛋白;亚细胞定位分析表明,IGF1R蛋白均匀地分布于内质网、高尔基体及质膜上,比例均为33.3%;磷酸化位点分析发现,IGF1R蛋白存在123个磷酸化位点;该蛋白的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。组织表达显示,IGF1R基因在昆明犬不同组织中均有表达,尤其在肺脏、心脏及肾脏中呈现高表达。【结论】IGF1R基因在生物进化过程中具有较强的保守性。昆明犬IGF1R蛋白具有IGF受体蛋白特征性结构域,属亲水性跨膜蛋白。IGF1R基因在昆明犬6个组织中均有表达,其中心脏、肺脏及肾脏组织中的表达量较高。
【关键词】昆明犬  IGF1R基因  克隆  序列分析  组织表达
【基金】云南省科技厅基础研究计划项目(202101AT070035);; 公安部科技强警基础工作专项项目(2017GABJC20)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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