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越冬期体色变异红罗非鱼差异表达miRNA的鉴定

2022-08-16分类号:S917.4

【作者】王兰梅  朱文彬  傅建军  罗明坤  董在杰  
【部门】中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室  南京农业大学无锡渔业学院  
【摘要】为了探究红罗非鱼越冬期体色变异的分子机制,实验构建了其2种体色(正常粉红体色和变黑体色)皮肤组织的小RNA文库,每组4个重复,组装后平均每组分别获得12 190 544和11 891 890条过滤后的读长(clean reads),获得miRNA成熟序列669个,其中337个是已知的miRNAs。鉴定出越冬期变黑体色相对于正常粉红体色鱼的差异表达的miRNAs 26个,其中上调11个,下调15个,且其中12个为已知的miRNAs,可能在红罗非鱼越冬期体色变异过程中发挥重要作用。富集分析发现了大量代谢和体色调控相关的通路。研究表明,红罗非鱼越冬期的体色变异可能是色素细胞的增值和迁移形成的,与代谢相关的调控通路在其中发挥重要作用,为解析红罗非鱼越冬期体色变异的机制奠定了基础。
【关键词】红罗非鱼  越冬  体色变黑  microRNA (miRNA)
【基金】国家自然科学基金青年基金(31802290);; 中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD37)
【所属期刊栏目】水产学报
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