【摘要】目的：通过比较分析北京“医药分开”“医耗联动”综合改革前后本地居民和外来就医患者治疗费用变化情况，为下一步卫生资源的配置与调整提供参考。方法：运用多阶段分层、整群抽样调查的方法，以卫生费用核算体系2011为基础，核算2016—2019年北京市医疗机构不同来源患者治疗费用情况。结果：2016—2019年，北京市医疗机构治疗费用以本地居民为主，外来就医患者治疗费用增长较慢，费用占比从29.35%降至27.33%，改革后本地居民服务量小幅增长，外来就医患者门诊服务量小幅下降，其门诊、住院次均费用均高于本地居民，但增长较慢。改革后不同来源患者药品费用占比均下降明显，卫生材料费用占比小幅下降。结论：北京市医疗机构虹吸效应明显，但本地居民与外来就医患者对医疗服务利用的重点不同，改革后本地居民与外来就医患者次均费用差异减小，患者费用结构均呈优化趋势，但改革对不同来源患者的影响不同，因此，应该合理调整北京市医疗卫生资源的规划与配置，在政策制定与效果评价时考虑不同来源患者受到的不同影响，提高精准性。