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甜玉米籽粒体积和粒重的全基因组关联分析

2022-07-15分类号:S513

【作者】肖颖妮  李高科  李坤  于永涛  李光玉  李武  高颖珊  胡建广  
【部门】广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室  
【摘要】为挖掘控制甜玉米籽粒体积和粒重的相关基因,2017—2019年,以209份甜玉米自交系构成的关联群体为材料,测定干籽粒的体积和粒重,结合全基因组重测序(De novo sequencing)获得的980万个单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)标记,采用GLM模型进行全基因组关联分析。结果表明,甜玉米籽粒体积变异范围为0.06~0.15mL,变异倍数为2.5倍,单粒重变异范围为0.08~0.17g,变异倍数为2.1倍,均符合正态分布。共检测到15个SNP位点与籽粒体积或粒重显著关联,分别解释籽粒体积55.7%和粒重52.1%的表型变异,其中4个位点和普通玉米报道的QTL重叠,其余11个是新鉴定的位点,通过基因注释发现大部分候选基因为转录因子等调控基因。此外,首次检测到Br2(矮化基因2)与籽粒体积、粒重两性状均显著关联,并且籽粒体积和粒重均随着该基因表达量的升高而增加。
【关键词】甜玉米  籽粒体积  粒重  全基因组关联分析
【基金】广东省重点领域研发计划(2018B020202008);; 省级乡村振兴战略专项(粤财农[2020]100号);; 广东省农业科学院学科团队建设项目(202115TD);; 广州市科技计划(201804020081);; 广东省基础与应用基础研究基金(2019A1515010305);; 科技创新战略-高水平农科院建设项目(R2017YJ-YB1002;R2018PY-QF006;R2018QD-048)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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