【摘要】鉴于目前欠缺同时测量分析中国中部与长三角地区国家级高新区科技创新效率的研究，在全社会科技创新投入不断增加的背景下，为更加客观准确地衡量国家级高新区的科技创新效率以及环境因素的影响，以中部和长三角两大区域内34家国家级高新区为研究对象，运用包含随机前沿分析方法在内的三阶段数据包络分析模型，对其2013—2018年的创新效率进行评价，并对比分析剔除环境因素和随机因素前后的效率值。结果发现：中部和长三角地区国家级高新区的科技创新效率逐年上升，但总体上尚有提升空间；环境因素对国家级高新区的科技创新效率有较大影响，位于省会城市和经济发达地市的国家级高新区的科技创新效率较高；两大区域国家级高新区的科技创新效率存在显著差异，主要由规模效率差异所导致。