【摘要】为客观、准确地比较地区生产总值（GDP）万亿元级城市的创新能力，确定城市创新能力比较体系中各指标的权重是基础和核心。首先，根据文献分析法及创新成果产出的特征，选取比较指标。其次，采用因子分析法对数据进行降维处理，再利用变异系数法、熵权法及主成分分析法，结合最小鉴别信息原理构建组合赋权模型对GDP达万亿元的国内城市的创新能力进行实证分析。结果表明，影响这类城市创新能力的主要因素为创新效率、创新实现、创新提升3个因子；这类城市整体创新能力一般，创新能力较强的城市有北京、深圳、上海、广州；不同地区的城市的创新能力有显著差异，东部地区城市的创新能力强于中西部地区城市。最后，结合重要影响因素，对如何提高生产总值万亿元级城市创新能力提出对策建议。