【摘要】基于创新经费集聚、创新人力集聚、创新机构集聚和创新成果集聚四大维度采用熵值法测度2009～2019年中国创新要素集聚水平，利用Dagum基尼系数分解和方差分解从空间和结构两个视角揭示中国创新要素集聚水平的差异及来源，并运用QAP方法研究创新要素集聚差异的形成机理。研究发现：创新要素集聚水平虽低但呈现缓慢上升趋势，其中创新人力集聚、创新机构集聚和创新成果集聚持续向好，而创新经费集聚呈下降趋势；区域间差异是创新要素集聚差异的主要来源，东部内部差异明显高于中部和西部地区，长江流域内部差异大于黄河流域；创新成果集聚差异是创新要素集聚差异的主要结构性来源；创新经费集聚差异对创新要素集聚差异作用强度从东向西依次增强，而创新成果集聚差异作用强度依次减弱，创新人力集聚差异和创新机构集聚差异在中部地区的作用强度最大，创新经费集聚差异对长江流域创新要素集聚差异的作用强度大于黄河流域，创新人力集聚差异、创新机构集聚差异和创新成果集聚差异的作用强度则相反。