伪狂犬病毒FJ 2012株感染湖羊肾脏的转录组谱特征及对FoxO通路的影响
2022-05-18分类号:S858.26
【部门】福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) 福建省兽医中药与动物保健重点实验室(福建农林大学) 福建省农业科学院畜牧兽医研究所
【摘要】采用Illumina第二代高通量测序技术对感染伪狂犬病毒PRV FJ 2012株的湖羊肾脏组织进行转录组测序,对两组羊的差异表达基因进行筛选,差异显著性表达的基因进行GO和KEGG显著性富集分析,最后选择qPCR验证分析部分差异表达基因的mRNA表达情况.结果表明,PRV FJ 2012株感染湖羊,与对照组相比肾脏中共发现2 679个差异表达基因,其中有1 269个基因下调,1 410个基因上调.GO显著性富集分析结果表明,PRV FJ 2012株感染湖羊肾脏涉及生物过程的差异表达基因最显著的GO生物学功能是蛋白质折叠,涉及细胞组分最显著的生物学功能是细胞核成分,涉及分子功能最显著的生物学功能是未折叠蛋白功能.KEGG分析表明,差异表达基因参与的代谢通路有316条,其中FoxO信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路差异最显著.本研究重点对FoxO通路的基因网络进行了分析,结果表明,该通路共有33个差异表达基因,其中22个下调,12个上调. qPCR验证结果表明,PRV FJ 2012株感染湖羊肾脏,基因STAT3、IL-6、FOXO3、BCL6、ATG8表达上调;基因IRS、SGK2、ATROGIN、PEPCK表达下调,其结果与FoxO信号通路转录组数据结果一致.
【关键词】伪狂犬病毒 湖羊 肾脏 转录组 FoxO信号通路
【基金】福建省属公益类科研院所专项(2019R1026-5);; 福建省自然科学基金项目(2019J02014);; 福建省科技重大专项专题(2019NZ09007)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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