【摘要】创新是一个国家和地区经济发展的重要驱动力，要素市场扭曲则对地区创新选择具有重要的影响。本文首先从理论上分析要素价格扭曲对资本深化以及地区创新选择的影响机制，并利用中国1994-2018年31个省市的面板数据对理论机制进行验证，研究表明：(1)要素价格扭曲是影响资本深化和地区创新选择的重要因素，资本深化是要素价格扭曲影响创新选择的重要机制。(2)要素价格扭曲通过加快资本深化进程抑制地区的自主创新能力提升，但有利于地区的技术引进创新。(3)进一步分析，要素价格扭曲对地区自主创新能力的抑制作用在不同时间段、地区、高等教育水平和市场化水平下存在异质性。基于上述分析，提出要素市场改革的政策建议。