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水稻柱头外露率主效QTL qTSE4的定位

2022-05-27分类号:S511

【作者】何晓娟  万华  高俊文  顾伟航  谢振威  赵志刚  万建民  
【部门】南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室  中国农业科学院作物科学研究所  
【摘要】[目的] 柱头外露率是杂交水稻制种中的一个重要指标,本研究旨在检测控制水稻柱头外露率QTL及精细定位相关基因。[方法] 以低柱头外露率粳稻品种‘02428’和高柱头外露率亲本ZH464配组的F_(2)群体进行QTL位点检测,在目标区域内利用分子标记筛选杂合单株连续自交获得F_(2:3)和F_(3:4)群体进行多年稳定QTL位点定位,同时利用BSA-seq技术对F_(3:4)群体进行了柱头外露率QTL定位和候选基因序列分析。[结果] 相关性分析结果显示单柱头外露率、双柱头外露率和总柱头外露率这3个性状存在极显著的相关。本研究以总柱头外露率作为表型数据,利用已构建的覆盖全基因组分子连锁遗传图谱进行QTL定位,检测到第2和4染色体上两个位点:qTSE2和qTSE4,选择贡献率大的qTSE4位点进行后续研究,该位点在F_(2:3)和F_(3:4)群体中重复检测到。结合BSA-seq测序结果,在qTSE4位点区间内筛选到两个存在差异的基因。[结论] qTSE4位点作为柱头外露相关的主效QTL位点,可进行后续的精细定位,筛选到的两个候选基因有待进一步转基因功能验证。
【关键词】柱头外露率  异交结实率  QTL定位  BSA-seq
【基金】江苏省重点研发专项(BE2021360);; 国家自然科学基金项目(31971909)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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