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灰飞虱G蛋白偶联受体基因的鉴定与分析

2022-05-31分类号:S435.112.3

【作者】徐圣  张怡萍  韩召军  吴敏  
【部门】南京农业大学植物保护学院  
【摘要】[目的]利用灰飞虱Laodelphax striatellus基因组和转录组数据鉴定灰飞虱G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)基因。[方法]构建灰飞虱基因组和转录组本地数据库,以黑腹果蝇Drosophila melanogaster和豌豆蚜Acyrthosiphon pisum的GPCR基因为参照序列进行本地BLAST,去除冗余和不含有多跨膜螺旋结构的序列后获得灰飞虱GPCR基因;利用NCBI CD-Search对灰飞虱GPCR序列进行跨膜结构域分析,利用Clustal W进行序列比对,用MEGA 6软件构建灰飞虱GPCR系统发育树。[结果]鉴定了114个灰飞虱GPCR基因,它们分属于A、B、C和D这4个家族。灰飞虱A家族的GPCR数量最多,尤其是其中的神经肽和蛋白激素受体亚家族的基因数量达55个。与黑腹果蝇的GPCR相比,灰飞虱GPCR不仅种类丰富,而且有基因重复和可能的缺失现象。[结论]灰飞虱具有较为全面的GPCR系统,本研究完善了灰飞虱GPCR基因的信息,为进一步研究灰飞虱GPCR的功能奠定了基础。
【关键词】灰飞虱  G蛋白偶联受体  基因家族  特征基序  基因重复与缺失
【基金】科技基础资源调查专项(2018FY101101)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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