【摘要】为探寻林下环境中黑木耳栽培生产过程中发生连作障碍现象的内在原因，研究黑木耳生产对于栽培场地土壤微生物群落结构的影响，在林下黑木耳实际生产基地选择生态环境条件相同的区域，设计在连续应用两年（L20）、应用一年空闲一年（L19）两个试验区域和空白对照区域（CK）采集土壤样本，利用高通量测序技术，分析不同处理组土壤样本中细菌和真菌群落结构的变化规律。结果表明：在测序结果足够反应样本所包含多样性的前提下，数据表明黑木耳栽培生产过程会明显提高土壤中细菌的种类和均匀程度，但应用后闲置的L19组土壤细菌的丰富度略高于连续应用的L20，而L19和L20组的细菌均衡度相近；通过细菌物种差异分析和分类学组分分析，可以发现3个处理组样品的相似性较低，表明土壤不同菌种在细菌总量中的占比存在一定的变化，但优势细菌的种类并没有明显的改变。在土壤真菌动态变化方面，黑木耳的连续生产（L20）明显的抑制了真菌物种丰富度和数量均衡度，生产后闲置会导致物种丰富度不足的前提下不同物种个体数量快速恢复均衡；通过真菌物种差异分析和分类学组分分析，证明土壤真菌多样性的动态变化更为剧烈和持久，主要表现在子囊菌和被孢霉在栽培后闲置期内大量的增殖，以及以黑木耳为主的担子菌快速消退；同时木霉属真菌在非黑木耳类真菌含量中比例的提升，可能是导致黑木耳连作过程中“绿霉病”高发的重要原因。