【摘要】[目的]长江流域是我国重要农业产业带，考察长江流域农业生态经济系统耦合协调发展水平及其差异化特征，对实现长江流域乃至全国农业农村现代化都具有重要的意义。[方法]基于2004—2018年长江流域省级面板数据，分别构建了农业生态经济系统综合评价指标体系，采用CRITIC—熵权组合权重法测算两者的综合发展水平，结合耦合协调度模型和Dagum基尼系数法，对两者耦合协调发展水平及其差异特征进行系统性分析。[结果]结果表明：（1）2004—2018年长江流域农业生态经济系统综合发展水平均呈上升态势，但农业经济系统发展较为滞后，且两者在总体上、区域间、省份间各有差异。（2）长江流域农业生态经济系统具有高度耦合特征，且耦合度呈现波动上升趋势，但不同区域表现有所差别。（3）长江流域农业生态经济系统的协调发展水平整体上呈阶梯式上升，协调等级常年稳定在初级协调状态，且中游相较于上、下游协调发展水平更好，区域内差异更小。（4）长江流域农业生态经济系统耦合协调发展水平总体差异呈现出波动走势，且基尼系数有扩大趋势，超变密度贡献率均值最大，但在考察期内，区域间差异与超变密度轮换构成影响长江流域农业生态经济系统协调发展水平差异的主要因素。