基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因
2022-05-15分类号:S543.9
【部门】福建农林大学动物科学学院(蜂学学院) 福建农林大学国家菌草工程技术研究中心
【摘要】以巨菌草(Pennisetum giganteum)的叶片、茎、根为试验材料,通过分析8个基因18s rRNA、Actin、GAPDH、ACTB、EF-1α、UBQ、CYP、TUB在正常生长、干旱以及盐碱胁迫下荧光定量PCR中稳定性表达情况,筛选巨菌草的稳定内参基因。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件计算内参基因的表达稳定值并进行排序,最终通过赋值法综合排序确定稳定内参基因。结果表明,内参基因的稳定性在不同处理下存在差异。其中,ACTB稳定性好,为本研究筛选出巨菌草的内参基因。本研究筛选出的内参基因,为后续巨菌草功能基因表达分析奠定了基础。
【关键词】巨菌草 实时荧光定量PCR 内参基因 稳定性评价 干旱胁迫 盐碱胁迫 赋值法综合排序
【基金】国家自然科学基金项目(32101418、42075116);; 福建省重大专项(2021NZ0101)
【所属期刊栏目】草业科学
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