【摘要】【目的】为了了解舟山海域不同功能区划之间浮游病毒和异养细菌的时空分布。【方法】于2017年冬季，2018年春季、夏季、秋季在舟山岛近岸海域不同功能区中选取6个典型站位，采集表层海水，获得24个样品。运用流式细胞仪技术对样品进行浮游病毒和异养细菌丰度检测，并对其相关的环境因子及其时空分布特点进行分析。【结果】浮游病毒（Viruses， Vir）的季节分布为：夏＞秋＞冬＞春，异养细菌（Heterotrophic Bacteria， HB）的季节分布为：夏＞春＞秋＞冬。相关性分析表明，春季，浮游病毒和异养细菌与pH均呈显著正相关关系，与化学需氧量（COD）呈显著负相关，浮游病毒与浮游病毒与异养细菌的相关性时指标（VBR）呈显著正相关；夏季，异养细菌与叶绿素-a（Chl-a）呈现正相关，与COD呈现显著负相关；秋季，浮游病毒与Chl-a呈现正相关，与COD呈现负相关，异养细菌与pH呈现正相关，与SiO_(3)~(2-)和COD呈显著负相关；冬季，浮游病毒与Chl-a呈正相关，异养细菌与pH呈现正相关，与COD呈显著负相关。【结论】舟山近岸海域浮游病毒和异养细菌的丰度可以直接或间接反映海域污染情况，并可作为检测水体污染的指标之一，以期为舟山不同功能区海域生态环境保护提供参考，为更全面研究舟山近岸海域的生态环境提供基础资料。