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宣和猪PID1基因外显子3的SNP检测及其与肉质性状的关联分析

2022-05-20分类号:S828

【作者】刘梅  朱怡轩  王孝义  陈强  董新星  严达伟  李明丽  
【部门】云南农业大学动物科学技术学院  
【摘要】【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料,对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测,选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的差异分析。【结果】在宣和猪PID1基因外显子3区域共检测出4个SNP位点,分别为253643 bp处的T→C(T253643C)、253675 bp处的G→C(G253675C)、253734 bp处的A→G(A253734G)和253827 bp处的G→A(G253827A)。4个SNP位点均检测出3种基因型,分别以等位基因T、G、G、A及基因型TT、GC、AG、AA的频率最高。4个SNP位点共有9种单倍型和24种单倍型组合,其中单倍型CGGA和单倍型组合CGGA/TCAA的频率最高。各位点杂合度在0.4490~0.4997,都属于中度多态且都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P >0.05),遗传多样性比较丰富。G253675C位点与大理石纹评分存在显著关联,其中GC基因型可显著提高大理石纹评分(P
【关键词】宣和猪  磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)基因  单核苷酸多态性  肉质性状  关联分析
【基金】国家重点研发计划项目(2018YFD0501206);; 云南省乡村振兴专项(202104BI090022);; 云南省重大科技专项计划项目(202102AE090039)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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