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紫苏甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因PfPMK的克隆与表达分析

2022-04-28分类号:S565.9

【作者】李辉  温春秀  刘灵娣  温赛群  唐映红  姜涛  
【部门】湖南文理学院生命与环境科学学院  河北省农林科学院经济作物研究所  
【摘要】为了研究甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)在紫苏萜类物质生物合成代谢通路中的重要作用,对紫苏转录组数据进行分析,挖掘出紫苏PMK基因参考序列,采用基因克隆技术从紫苏中克隆了PMK基因,利用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法对紫苏PMK基因进行了分析。结果表明,紫苏PMK基因开放阅读框(ORF)全长为1 524 bp,编码507个氨基酸。生物信息学分析显示,PfPMK的分子质量为54.73 ku,等电点为5.20,为亲水蛋白;紫苏PfPMK氨基酸与SmPMK、SsPMK、SbPMK和PvPMK同源性较高,说明紫苏PfPMK蛋白在进化过程中保守性较强。亲缘关系分析显示,PfPMK与丹参和一串红的PMK亲缘关系很近,在线软件WoLF-PSORT预测PfPMK蛋白可能定位于质膜或内质网膜上。qRT-PCR结果表明,PfPMK基因在紫苏根、茎、叶中均有表达,在根中的表达量高于在叶和茎中的表达量;紫苏不同生长发育时期的qRT-PCR分析显示,PfPMK基因在9月中下旬表达量较高。首次从紫苏中克隆出PfPMK基因,生物信息学分析该基因属于甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因,参与了紫苏萜类物质的生物合成。
【关键词】紫苏  PfPMK  萜类  生物信息学  功能分析
【基金】河北省农林科学院基本业务经费(494-0403-YBN-1NKE);; 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-21);; 省部共建秦药特色资源研究开发国家重点实验室(培育)开放课题(QY202102)
【所属期刊栏目】华北农学报
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