苹果MdSGR2基因克隆及植物超表达载体构建
2022-04-28分类号:S661.1
【部门】山西农业大学园艺学院 果树种质创制和利用山西省重点实验室
【摘要】STAYGREEN(SGR)基因在植物叶绿素降解代谢过程中起重要作用。为探究苹果SGR2基因的生物学功能,利用RT-PCR技术从澳洲青苹成熟果皮中克隆得到MdSGR2基因,利用生物信息学分析软件对其编码蛋白进行了同源性、理化性质、蛋白结构、启动子顺式作用元件等预测和分析,并构建其植物超表达载体。结果表明,MdSGR2基因完整开放阅读框(ORF)cDNA序列为840 bp,编码279个氨基酸,该蛋白属于Staygreen超家族。理化性质分析表明,该蛋白分子质量为31.27 ku,等电点pI为8.52,属不稳定亲水蛋白。同源性分析表明,MdSGR2蛋白与秋子梨SGR同源性最高,达84.12%。蛋白质结构分析表明,该蛋白二级结构和三级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲构成,二者比例分别为40.50%,44.44%。启动子分析表明,该基因启动子区域包含低温顺式作用元件、光响应元件和脱落酸、水杨酸、茉莉酸甲酯响应元件等诱导型顺式作用元件,说明MdSGR2基因可能受环境和激素等多种因素的调控。同时研究成功构建了MdSGR2基因植物超表达载体pCAMBIA2301-MdSGR2。
【关键词】苹果 MdSGR2 基因克隆 生物信息学分析 超表达载体
【基金】山西省应用基础研究计划项目(201701D221187);; 山西农业大学引进人才科研启动项目(2014YJ01);; 山西省重点研发计划重点项目子课题(201703D211001-04);; 山西省基础研究计划项目(20210302123396)
【所属期刊栏目】华北农学报
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