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基于RNA-seq的番茄青枯病响应基因鉴定与表达分析

2022-04-28分类号:S436.412.15

【作者】史建磊  熊自立  苏世闻  王克磊  宰文珊  
【部门】温州科技职业学院  福建农林大学农学院  
【摘要】为了挖掘番茄青枯病抗性基因,对青枯菌侵染前后的不同番茄自交系进行转录组测序(RNA-seq)。结果发现,在12个样本中共获得75.02 Gb的高质量数据,以差异倍数(FC)≥2且错误发现率(FDR)
【关键词】番茄  青枯菌  转录组  差异表达基因  基因注释  定量表达
【基金】浙江省农业新品种选育重大科技专项子课题(2021C02065);; 温州市基础性科研项目(N20180003);; 温州国家农业科技园区开放性项目(K20200006);; 温州市农业新品种选育协作组项目(2019ZX007)
【所属期刊栏目】华北农学报
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