【摘要】2017—2020年我国一流大学建设高校的经费预算平均增长了31.29%,一流大学建设的经费投入及效率受到学界及社会的广泛关注。笔者使用国际通用的投入产出指标，采用三阶段DEA方法分析一流大学建设高校经费投入效率情况，并运用Tobit模型分析经费投入和使用结构对效率的影响。研究发现，我国一流大学建设高校经费投入效率较高，并呈现“西部最高、东部次之、中部最低”的区域差异特征；规模效率是影响技术效率的主要因素，纯技术效率小于1会带来明显的学术产出不足；城市人均GDP、财政投入教育的比例、一流大学建设高校数量对经费投入效率有正向作用；财政拨款、事业经费、捐赠经费占比对效率的影响呈“U型”,基本支出占比对效率的影响呈“倒U型”。应适当控制一流大学建设高校的规模，提升学术影响力，优化经费结构，建立经费投入效率监督问责机制。