【摘要】随着《政府会计制度》的落地实施，政府部门财务报告编制范围逐步扩大，公立医院将需要编制政府部门财务报告，这对公立医院财务工作提出了挑战。为了更好应对政府部门财务报告编制工作，文章梳理公立医院在编制政府部门财务报告过程中可能面临的困难，尤其对内部交易抵销工作中存在的困难进行详细分析，并提出相关建议，旨在为公立医院财务人员编制政府部门财务报告提供参考。