【摘要】新政府会计制度已经实施了一段时间，各行政事业单位实施过程中也遇到了很多问题，尤其是在一些特殊事项的处理上。由于不同行政事业单位对特殊事项会计处理方式存在多种不同理解，进而导致实务处理过程中会计人员仍然存在一些难点和困惑。基于上述原因，本文在明确新政府会计制度变化及特殊事项处理难点的基础上，结合案例对受托代理业务、质量保证金、长期土地流转合同和差异调节表编制四类特殊事项会计处理及问题进行深入分析，并从政府会计制度完善、内部控制体系健全和会计人员培训方面思考带来的启示。